Nie je možné čokoľvek získať, bez toho aby ste niečo neobetovali. Aby ste niečo získali, musíte dať vec rovnakej hodnoty. Tak znie hlavný zákon alchýmie - princíp rovného obchodu. Príbeh o bratoch Elricových, Edwardovi a Alphonsovi, ktorým práve zomrel jediný rodič - matka. Alchýmia je mocná veda a Edward s Alphonsom sa rozhodnú s jej pomocou matku oživiť. Ľudská transmutácia je však v alchýmii najväčšie tabu. Bratov stojí porušenie tohto tabu vysokú cenu. Alphonse stráca telo a jeho duša je prichytená k starému brneniu, Edward zase ruku a nohu, ktoré nahradzujú kovové protézy - automaily. A matka stále neožíva. Bratia si sľúbia, že získajú svoje telá späť. Veria, že im k tomu pomôže legendárny kameň mudrcov.